在播种前浇足底水的情况下，出苗前苗床一般不会缺水。但出苗后幼苗生长逐渐加快，需水量大。而在电热温床或火道温床上，水分蒸发量大，床土易失水干燥。因此应根据土壤水分情况及时补充水分。
肥水管理：苗床上应严格控制浇水。苗床湿度大时，一方面会引起幼苗徒长，易诱发病害；另一方面也会影响根系的正常生长，发生沤根。床内湿度较大时，可控制浇水，结合划锄进行散湿提温。浇水时最好浇温水。在瓜苗生长过程中，若发现缺肥现象，可结合浇水进行少量追肥，一般可用0.1％～0.2％尿素水浇苗，也可在叶面喷施0.2％的磷酸二氢钾或0.3％的尿素。通常情况下，只要育苗营养土是严格按照前文所介绍的方法配制，瓜苗不会发生缺肥现象。
一是“白土”育苗，即由于缺乏充足的可用有机肥，在配制营养土时，主要利用大田土，肥力差，造成幼苗出土后缺肥。
二是营养土采用生料配制，即用未腐熟好的过量有机肥，或过量速效化肥，造成幼苗烧根，发生幼苗缺肥现象。三是育苗温床温度过低、湿度过大造成幼苗沤根而发生的幼苗缺肥现象。
在育苗中应找准发生缺肥现象的原因，有的放矢，对第一种缺肥现象应采取追肥方式，第二种应结合水洗压肥，第三种应采取提温散湿的方法来处理。在育苗期间，除浇足底水外，一般还需浇水1～2次。
